Bazę dydaktyczną i naukową Katedry stanowią obiekty znajdujące w Olsztynie, przy pl. Cieszyńskim 1. Są to:
- Laboratorium Chemii organicznej i Biochemii żywności,
- Laboratorium Chemii ogólnej,
- Pracownia analizy białka,
- Pracownia chromatograficzna,
- Pracownia proteomiczna,
- Pracownia spektrofotometryczna,
- Pracownia chemiczna,
- Pracownia analizy wagowej,
- Pracownia magisterska.