Działalność badawcza Katedry koncentruje się głównie na molekularnych podstawach funkcji i struktury hydrokoloidów, głównie białek żywności oraz mechanizmie ich proteolizy. Tematyka badawcza dotąd opublikowanych, wzajemnie komplementarnych prac z tego zakresu dotyczy:

• mechanizmu proteolizy białek żywności;
• mechanizmu tworzenia się i właściwości fizykochemicznych oraz biologicznych kompleksów białkowych;
• fizykochemicznej charakterystyki koncentratów białek mleka;
• molekularnych podstawy funkcjonalnych właściwości hydrokoloidów i produktów ich degradacji;
• białek żywności jako potencjalnego źródła bioaktywnych peptydów (komputerowe bazy danych, metody bioinformatyczne oceny wartości białek);
• projektowania procesów proteolizy w aspekcie pozyskiwania biologicznie aktywnych peptydów;
• metodyki związanej z izolowaniem, rozdziałem i identyfikacją peptydów żywności oraz enzymów proteolitycznych;

Efektem badań prowadzonych przez pracowników Katedry jest szereg publikacji naukowych (oryginalnych i przeglądowych) o charakterze poznawczym i utylitarnym, z których wiele opublikowano w czasopismach z IF. Uzupełnieniem publikacji naukowych są referaty i komunikaty naukowe przedstawiane na sympozjach oraz konferencjach naukowych, zarówno krajowych, jak i zagranicznych. Na dorobek pracowników Katedry składają się również wydawnictwa dydaktyczne, w skład których wchodzą podręczniki i skrypty akademickie wydane przez Wydawnictwo Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego (d. Akademii Rolniczo-Technicznej).

Istotnym elementem pracy Katedry jest ścisły związek z zakładami przemysłowymi. Pracownicy są autorami wielu ekspertyz i opinii opracowanych na zlecenie jednostek gospodarczych.